Protein–RNA interactions for Protein: Q9D476

4933407L21Rik, RIKEN cDNA 4933407L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933407L21RikQ9D476 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933407L21RikQ9D476 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms