Protein–RNA interactions for Protein: Q9D443

4933415A04Rik, RIKEN cDNA 4933415A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933415A04RikQ9D443 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
4933415A04RikQ9D443 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4933415A04RikQ9D443 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms