Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Trmt44Q9D2Q2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Trmt44Q9D2Q2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms