Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Urm1Q9D2P4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Urm1Q9D2P4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Urm1Q9D2P4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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