Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tssk3Q9D2E1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tssk3Q9D2E1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tssk3Q9D2E1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tssk3Q9D2E1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tssk3Q9D2E1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tssk3Q9D2E1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms