Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms