Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmbr1lQ9D1E5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmbr1lQ9D1E5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms