Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Syf2Q9D198 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syf2Q9D198 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms