Protein–RNA interactions for Protein: Q9D110

Mthfs, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfsQ9D110 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MthfsQ9D110 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MthfsQ9D110 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MthfsQ9D110 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms