Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NkapQ9D0F4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NkapQ9D0F4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms