Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prelid3bQ9CYY7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prelid3bQ9CYY7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms