Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrs1Q9CYH6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms