Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssu72Q9CY97 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssu72Q9CY97 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssu72Q9CY97 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms