Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK4

Slc50a1, Sugar transporter SWEET1, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc50a1Q9CXK4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc50a1Q9CXK4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc50a1Q9CXK4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms