Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd3Q9CWR2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd3Q9CWR2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms