Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MINDY3Q9CV28 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms