Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud1Q9CUB6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms