Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a2Q9CTG6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a2Q9CTG6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms