Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snw1Q9CSN1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snw1Q9CSN1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms