Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRW3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CRW3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CRW3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms