Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5sQ9CRA7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms