Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl28Q9CR40 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms