Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg12Q9CQY1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms