Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sec61bQ9CQS8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms