Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQF4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms