Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms