Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4921530L21RikQ9CQ47 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921530L21RikQ9CQ47 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms