Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl49Q9CQ40 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms