Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe41Q99PV5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe41Q99PV5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms