Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim26Q99PN3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim26Q99PN3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms