Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GpnmbQ99P91 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms