Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atoh8Q99NA2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atoh8Q99NA2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms