Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brms1Q99N20 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brms1Q99N20 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms