Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PccbQ99MN9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PccbQ99MN9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms