Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkd1Q99MH6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms