Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL3

Chst12, Carbohydrate sulfotransferase 12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst12Q99LL3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst12Q99LL3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chst12Q99LL3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms