Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnpo2Q99LG2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms