Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds2Q99L43 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms