Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW9

Itfg1, T-cell immunomodulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itfg1Q99KW9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itfg1Q99KW9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itfg1Q99KW9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms