Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q99KU6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q99KU6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q99KU6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q99KU6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q99KU6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q99KU6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q99KU6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q99KU6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q99KU6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q99KU6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q99KU6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q99KU6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q99KU6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q99KU6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q99KU6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q99KU6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q99KU6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q99KU6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Q99KU6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q99KU6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q99KU6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q99KU6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q99KU6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Q99KU6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q99KU6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q99KU6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q99KU6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q99KU6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Q99KU6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q99KU6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q99KU6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q99KU6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q99KU6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q99KU6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q99KU6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q99KU6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q99KU6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q99KU6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q99KU6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q99KU6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q99KU6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q99KU6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q99KU6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q99KU6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q99KU6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q99KU6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q99KU6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q99KU6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q99KU6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q99KU6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q99KU6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q99KU6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q99KU6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q99KU6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q99KU6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q99KU6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms