Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmp1Q99KU0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms