Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ciao1Q99KN2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ciao1Q99KN2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms