Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab28Q99KL7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms