Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl22Q99JN2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl22Q99JN2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl22Q99JN2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl22Q99JN2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl22Q99JN2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl22Q99JN2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl22Q99JN2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl22Q99JN2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms