Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Def8Q99J78 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Def8Q99J78 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms