Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc33a1Q99J27 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc33a1Q99J27 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc33a1Q99J27 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc33a1Q99J27 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc33a1Q99J27 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc33a1Q99J27 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc33a1Q99J27 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc33a1Q99J27 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc33a1Q99J27 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc33a1Q99J27 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms