Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF488Q96MN9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF488Q96MN9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms