Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf144aQ925F3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf144aQ925F3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms