Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Xrcc4Q924T3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrcc4Q924T3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms