Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Letmd1Q924L1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Letmd1Q924L1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Letmd1Q924L1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Letmd1Q924L1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Letmd1Q924L1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Letmd1Q924L1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Letmd1Q924L1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Letmd1Q924L1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms